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  • 2023-01-21 » フィンガープリントによる部分構造の可視化について
    2022-12-16 » 特別なソフトなしに化合物3Dモデルを動かしてもらう
    2022-09-26 » M1 MacのDocker上でのR studio環境構築
    2022-09-20 » Windowsではコードブロックのフォントを指定しないと見づらくなるという教訓
    2022-07-01 » optunaで多目的最適化
    2022-06-16 » highlight.jsの自動言語判別を無効化する
    2022-06-11 » 【OptunaでSHAP】ハイパーパラメータ探索での寄与率を計算してみた
    2022-05-07 » 自分の作ったパッケージをconda installできるようにする。
    2022-04-15 » 新しいMacbookをセットアップしたときにやったこと
    2022-03-12 » 【Docker】Jupyter Notebookを使うセットアップ
    2022-01-15 » 【Docker】マルチアーキテクチャ対応のイメージをビルドする
    2021-12-24 » 【Git】追跡ブランチを確認,変更する方法.
    2021-12-03 » 【Matplotlib】マーカー一覧を取得する方法
    2021-10-23 » 【Word】数式が勝手にCambria Mathになるのを防いで,LaTeXの数式フォントにする方法【Mac】
    2021-10-21 » Github-Pagesをローカルで試すときにhttpsでなくて困った話
    2021-09-04 » Dockerfileでconda activateする方法
    2021-08-28 » ドキュメントをdocstringから生成する【2021/08/29時点】
    2021-08-05 » 同じネットワーク内でMacからLinux (Ubuntu 18.04) にsshでアクセスする方法.
    2021-07-23 » 自作のパッケージをPyPIにアップロードする方法
    2021-07-22 » Markdownの記法,およびレイアウトのテスト
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  • 2022-08-12 » 【Python】内挿・外挿の判定
    2022-08-12 » 自分がよく用いる特徴量削減手法まとめ
    2022-07-31 » 【Python】モンテカルロ法でネイピア数eを推算してみた
    2022-07-30 » 【Python】モンテカルロ法で円周率を推算してみた
    2022-02-14 » 【日本語名】matplotlibのlinestyle
    2021-08-19 » NGBoostの確率解釈について
    2021-07-23 » ゼロから作るDeepLearning 第3章 ニューラルネットワーク でとったノート
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  • 2022-10-05 » shap.summary_plotでカラーバーが表示できない
    2022-05-06 » conda skeletonで、KeyError:'extras_require'が起きたときの対処法
    2022-04-15 » 新しいパソコンでGitを設定したときにハマったこと
    2022-03-19 » Dockerでapt-get updateが失敗するとき確認すること
    2021-12-11 » 【MathJax】v2からv3に移行したらディスプレイスタイルが表示されなくなった
    2021-08-28 » _TIPropertyValueIsValid called with 4 on nil context!が出る原因と対処法

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yu9824 材料科学と機械学習に興味があります。

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フィンガープリントによる部分構造の可視化について
マテリアルズインフォマティクス (MI) において最も重要な要素のうちの一つとして、モデルの解釈が挙げられる。モデルを解釈することで、ドメイン知識と照らし合わせてモデルの正しさを確認することや新たな知見を得ることができる。化学構造とその化合物の性質を紐づけて解析を行う定量的構造物性相関 (Quantitative...
特別なソフトなしに化合物3Dモデルを動かしてもらう
特別なソフトを使わずに化合物の3次元構造を描画できるようにしたかった。実際、世の中に化合物を描画するソフトはたくさんあるが、基本的に自分だけでなく見る相手にもそのソフトを使用してもらう必要がある場合がほとんどである。一般に、会社のPCにソフトをインストールするためには複雑な申請が必要であるケースがある(特に大きな...
shap.summary_plotでカラーバーが表示できない
shapで解析した結果を可視化しようとした際、よくわからないmatplotlibのエラーに遭遇した。調べても出てこず、色々試した結果うまくいったのでエラーコードと共に対処法を示す。バグなのか仕様変更なのかはわかっていない。
M1 MacのDocker上でのR studio環境構築
訳があってRをやらなくてはならなくなった。環境構築をするにあたってローカルにインストールすることも考えたが、再現性やソフトの競合を避けるという意味でdockerコンテナ上に環境を構築することにした。単にrstudioのイメージを使用して環境構築することができなかったが、いくつか工夫をすることで対処することが可能だ...
Windowsではコードブロックのフォントを指定しないと見づらくなるという教訓
自分の環境では気づかなかったが、Windowsにおいてコードブロックのフォントが見づらいものになってしまった。これを解決するためにコードブロック用のWebフォント(Ricty Diminished)を設置し、指定することにした。

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